早前，GameInformer 发现，一些需要订阅任天堂 Switch Online 以开启在线游玩功能的游戏，竟然无法使用云存档功能。该媒体查阅任天堂官方网站，发现上面的确有指出「该款游戏不支援云存档功能」。针对这一点，任天堂官方表示：「绝大部分任天堂 Switch 游戏都支持云存档功能，但在某些游戏中，此功能可以让玩家重新获得已经交易给其他玩家的物品，又或者在线上多人游戏中回溯到更高的排名。为了确保公平竞争，这类游戏可能无法启用运存档。」